馬祖原名為媽祖島，後改為馬祖。早年先民從福建移居，建造特殊的閩東式石屋建築，在北竿的芹壁、東莒大浦聚落、福正聚落都保存著完整的石屋聚落；而馬祖群島豐富的自然景觀與地質地貌及漁村產業文化，都給人帶來強烈的在地印象。本館108年起規劃了「島嶼對話-馬祖文化交流計畫」，從馬祖的建築、自然景觀與漁村生活三個特色出發，藉藝術增加島嶼文化的互動，並在馬祖傳播多樣化的藝術形式，引起在地創新思維與獲取新資訊。
【計畫目標】一、培養文藝生活透過村落文化演繹與踏查，藝術家生活世界放入馬祖在地知識，讓藝術家在當地常住及藝術行動，與社區、學校及在地藝文創作資源，結合文化體驗活動，接受他方之文化饗宴，加強彼此的認識與經驗交流，形成共生合作關係，同時驗證自身的社區文化特色。二、扶植文化觀光以藝文深化馬祖印象，並參與馬祖文化生活環境營造，結合在地智慧與知識傳承及推展，促進在地知識的積累及文化觀光發展的可能性。三、打造藝術游擊徵選本島年輕藝術家前往馬祖駐村，規劃工作坊、文化體驗等型態展現駐村成果。
108年 「藝術游擊」藝術家馬祖駐村
109年 「藝術游擊」藝術家馬祖駐村
110年 「藝術游擊」藝術家馬祖駐村
111年 「藝術游擊」藝術家馬祖駐村
112年 「藝術游擊」藝術家馬祖駐村
113年 「藝術游擊」藝術家馬祖駐村
108年「島嶼對話」馬祖寫生交流作品展
109年「藝術游擊」藝術家馬祖駐村成果展
110年島嶼對話-馬祖文化交流計畫 「藝術游擊」藝術家「返場」
112年島嶼對話-臺馬藝術交流計畫 「藝術游擊」藝術家「返場」